리노 네바다 대학교 생물학과 부교수인 Julie Allen 박사는 플로리다 자연사 박물관 슬롯 그룹과 함께 빅 데이터를 사용하여 오랫동안 지속된 문제를 해결하라는 "행동 촉구"를 발표했습니다. 식물의 다양성과 진화에 관한 질문을 던지고 점점 인간이 지배하는 지구에서 식물의 생명이 어떻게 살아갈지 예측합니다.
에2018년 12월 31일 Nature Plants에 게시된 논평, 슬롯들은 동료들에게 연구에서 대규모의 공개 액세스 데이터 리소스를 활용하고 남은 데이터 격차를 메워 이러한 리소스를 성장시키는 데 도움을 줄 것을 촉구했습니다.
"글로벌 규모의 주요 생물 슬롯 문제를 해결하기 위해 빅 데이터를 사용하는 것은 보존 노력부터 기후 변화의 영향 예측 및 완충에 이르기까지 엄청난 실제적 의미를 갖습니다."라고 연구 저자이자 플로리다 박물관 큐레이터이자 저명한 교수인 Doug Soltis가 말했습니다. 플로리다 대학교 생물학과.
수세기에 걸쳐 자연사 박물관은 수십억 개의 표본과 관련 데이터 컬렉션을 구축했으며, 그 중 대부분은 현재 온라인에서 볼 수 있습니다. 원격 센서 및 드론과 같은 신기술을 통해 슬롯들은 식물과 동물을 모니터링하고 실시간으로 데이터를 전송할 수 있습니다.
이러한 데이터 리소스는 슬롯와 환경보호론자에게 지구상 생명체의 과거, 현재, 미래에 대한 풍부한 정보를 제공합니다. 이러한 데이터베이스가 성장함에 따라 방대한 데이터 세트를 분석하고 연결하는 데 필요한 계산 도구도 늘어났습니다.
이전에는 소수의 종 또는 단일 슬롯 군집에 초점을 맞춘 연구를 이제 DNA 서열을 저장하는 GenBank, 플로리다 대학이 주도하는 iDigBio와 같은 데이터베이스의 개발 덕분에 글로벌 수준으로 확장할 수 있습니다. 미국 자연사 컬렉션과 종의 위치 정보 저장소인 글로벌 생물다양성 정보 시설(Global Biodiversity Information Facility)을 디지털화합니다.
이러한 리소스는 식물 진화와 생태학에 대한 근본적인 통찰력을 추구하는 슬롯부터 보전이 가장 필요한 지역을 식별하려는 토지 관리자 및 정책 입안자에 이르기까지 광범위한 사용자에게 유용할 수 있다고 공동 책임자인 Julie Allen이 말했습니다. 저자이자 네바다 대학교 리노 생물학과의 조교수입니다.
지구의 식물이 의학적 환자라면 소규모 연구를 통해 구순 포진이나 내향성 발톱에 해당하는 식물을 조사할 수 있습니다. 빅데이터를 통해 슬롯들은 전 세계 식물의 건강 상태를 전체적으로 더 명확하게 이해하고 적시에 진단을 내리며 올바른 치료 계획을 처방할 수 있습니다.
이러한 계획은 긴급히 필요하다고 Allen은 말했습니다.
"우리는 전례 없는 양의 데이터가 서식지 손실, 기후 변화 등 생물 다양성에 대한 세계적인 위협과 교차하는 흥미롭고 무서운 시기에 살고 있습니다."라고 Allen이 말했습니다. "슬롯의 활동 방식, 현재 위치, 이유 등 우리 세계를 형성하는 프로세스를 이해하면 슬롯이 미래 변화에 어떻게 대응할 수 있는지 파악하는 데 도움이 될 수 있습니다."
이러한 지역 및 글로벌 변화를 추적하는 것이 왜 그렇게 중요한가요?
공동 저자이자 박물관 연구원인 Ryan Folk는 "우리는 슬롯 없이는 살아남을 수 없습니다"라고 말했습니다. "많은 그룹이 꽃 피는 슬롯의 그늘에서 진화했습니다. 이러한 슬롯이 퍼지고 다양해짐에 따라 개미, 딱정벌레, 양치류 및 기타 유기체도 마찬가지였습니다. 이들은 오늘날 우리가 지구상에서 볼 수 있는 다양한 생명체의 기본 층입니다."
슬롯 리소스를 사용하고 늘리는 것 외에도 저자는 과학계가 생물학적 빅데이터 사용에 남아 있는 가장 어려운 장애물 중 하나인 데이터베이스가 서로 원활하게 작동하도록 하는 문제를 해결하기를 바랍니다.
"이것은 여전히 큰 제한 사항입니다." Allen이 말했습니다. "각 시스템의 데이터는 완전히 다른 방식으로 수집되는 경우가 많습니다. 이를 통합하여 원활한 방식으로 연결하는 것이 주요 과제입니다."
플로리다 박물관의 생물 슬롯 정보학 부큐레이터인 Robert Guralnick과 저명한 교수이자 분자 체계 및 진화 유전학 박물관 큐레이터이자 University of Florida의 생물 슬롯 연구소 소장인 Pamela Soltis도 이 연구를 공동 집필했습니다.
박사. Julie Allen은 이번 가을 학기에 조슬롯로 생물학과에 합류했습니다.
