게놈 서열 분석을 통해 코로나19를 유발하는 새로운 코로나바이러스(nCoV-SARS2)에 대해 많은 것이 밝혀졌으며 이제 슬롯 사이트는 이 중요한 과학 지식 체계에 기여하고 있습니다. 그만큼슬롯 사이트 유전체학 센터슬롯 사이트 대학에서 Reno는 처음에 바이러스 양성 반응을 보인 슬롯 사이트 북부와 남부의 샘플에 대한 게놈 서열 분석을 완료하고 있습니다.슬롯 사이트 주 공중 보건 연구소(NSPHL). 이러한 노력은 NSPHL과 미생물학 및 면역학부의 연구원들과 협력하여 이루어지고 있습니다.슬롯 사이트 대학교 리노 의과대학.
"아마도 가장 큰 이점은 슬롯 사이트 북부와 남부에 어떤 바이러스 변종이 있는지 알아내는 것일 것입니다."라고 대학의 여러 핵심 실험실 시설 중 하나인 슬롯 사이트 유전체학 센터 소장인 Paul Hartley 박사가 말했습니다. .
전 세계적으로 연구자들은 바이러스의 게놈을 공유하여 계통발생수를 확립하거나 UNR Med 부교수 Subhash Verma 박사가 설명하는 것처럼 바이러스에 대한 완전한 관점을 구축하고 있습니다. 이미 게놈 분석에 따르면 뉴욕의 바이러스는 유럽의 변종인 반면, 서부 주에서는 아시아 바이러스의 변종인 경향이 있는 것으로 나타났습니다.
게놈 분석은 질병의 중증도와 관련된 요인에 대한 이해를 향상시킬 수도 있습니다. 기본 조건과 유전학은 바이러스가 다른 바이러스보다 더 심각한 질병을 일으키는 이유를 설명하는 데 도움이 되지만, 바이러스 계통도 원인일 수 있습니다.
“묻고 대답할 수 있는 질문이 너무 많습니다.” Verma가 말했습니다.
Hartley는 24개가 넘는 샘플의 서열을 분석했으며 목표는 슬롯 사이트에서 거의 총 200개의 샘플을 서열 분석하는 것입니다. 샘플이 NSPHL을 떠나기 전에 RNA 추출 과정이 바이러스를 비활성화하고 추가 테스트를 거치면서 감염 가능성을 제거합니다.
하틀리가 샘플을 준비하고, 이를 라이브러리라고 부르는 것으로 변환하고, 바이러스 서열을 위해 해당 라이브러리를 강화하고 라이브러리의 서열을 분석해야 하기 때문에 서열 분석을 완료하는 데 약 일주일이 걸립니다. 그는 또한 데이터 분석을 수행해 왔으며 획득된 돌연변이 또는 변종을 기반으로 샘플이 서로 어떻게 관련되어 있는지에 대한 계통 발생 트리를 생성하는 분석 파이프라인을 개발했습니다.
순서화된 결과는 국제 데이터베이스에 보관될 것이며 Verma와 조교수 Cyprian Rossetto 박사, NSPHL 이사 Mark Pandori 박사를 포함한 UNR Med 연구원들이 추가 연구와 데이터 분석을 완료할 것입니다. .디.
Rossetto와 Verma는 바이러스학자이며 바이러스 연구에 DNA 및 RNA 염기서열 분석을 적용하는 전문가입니다. Rossetto가 말했듯이 "우리는 여기 UNR에서 바이러스 서열 분석에 대해 오랜 역사를 갖고 있으며 추가 장비와 Hartley 박사의 전문 지식을 통해 더 많은 기능이 가능해졌습니다."
하틀리은 유전체학, 전산 생물학 및 차세대 시퀀싱 분야의 전문 지식을 갖춘 분자 생물학자입니다. 전문성의 융합을 더하는 것은판도리, 분자 진단(DNA 기반 테스트) 분야에서 위원회 인증을 받은 공중 보건 미생물학자입니다. Pandori의 리더십 하에 NSPHL은국내 최초의 공중보건 연구실자체 코로나19 샘플 수집 키트를 구축하고 있으며제한적 항체 테스트 시작 준비앞으로 몇 주 안에.
Verma와 Rossetto는 추출된 환자 샘플에서 직접 차세대 시퀀싱을 완료하기 위해 Nevada Genomics Center를 배치한 것으로 Hartley의 공로를 인정받았습니다. 일부 실험실에서는 바이러스를 먼저 배양해야 합니다.
이 유전체학 분석 프로젝트는 대학의 연구 혁신과 UNR Med 미생물학 및 면역학과의 지원을 받습니다.
연구 및 혁신의 일부인 슬롯 사이트 유전체학 센터는 연구 또는 작업에 유전체학 도구를 사용하는 데 관심이 있는 학계 및 업계 연구원을 지원합니다. 자세한 내용은 다음을 방문하세요.슬롯 사이트 유전체학 센터 웹사이트.
