생물정보학 가격 및 슬롯 커뮤니티
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차세대 시퀀싱
RNA-Seq 분석, de novo 전사체 어셈블리, 전체 게놈 시퀀싱, 게놈 재배열, 단일 세포 시퀀싱 등을 포함한 차세대 시퀀싱 데이터 분석을 제공합니다.
우리는 바코드 역다중화, 판독 정렬, UMI 인식 유전자 수준 정량화, QC 매트릭스, 세포 유형 식별 등을 포함하는 10x Genomics 및 Drop Seq 단일 세포 RNA 시퀀싱 플랫폼을 위한 데이터 분석 파이프라인을 구축했습니다.
우리는 RNA 서열(RNA-seq) 분석 및 차별적으로 발현되는 유전자 식별에 대한 광범위한 경험을 보유하고 있습니다. 당사의 일반적인 RNA-seq 워크플로우에는 데이터 품질 관리, 입력 서열 데이터 정리, 참조 게놈 및 유기체 유전자에 대한 정렬, 전사체 풍부도 정량화, 조건 간 발현에 상당한 차이가 있는 유전자에 대한 통계 테스트가 포함됩니다.
차세대 시퀀싱과 그에 따른 대량의 시퀀스 데이터의 신속한 생성으로 비록 상당한 계산상의 어려움이 있음에도 불구하고 비모델 유기체 연구자에게 전체 전사체 재구성의 가능성이 확대되었습니다. 우리는 이러한 과제를 해결하고 품질 관리, 오류 수정, Trinity 및 추가 최첨단 조립 알고리즘, 조립 평가, 여과 및 단백질 주석을 통합하는 새로운 전사체 조립 슬롯 커뮤니티를 제공하는 것을 목표로 합니다.
핵심 인력은 개인 및 집단 내 변이의 전체 게놈 및/또는 표적 서열 식별을 슬롯 커뮤니티하고 유전자형 분석을 포함한 응용 분야에 대한 새로운 돌연변이, 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP), 삽입 삭제 및 구조적 변이를 식별하기 위한 재배열 툴킷을 개발했습니다. - 시퀀싱별 및 직접 순방향 유전자 매핑별 시퀀싱.
질량분석 단백질체학
고처리량 질량 분석기 단백질체 슬롯 커뮤니티 지원에는 라벨 프리, SILAC 및 TMT 데이터의 다운스트림 분석이 포함됩니다. 우리는 PD로부터 단백질 식별 및 정량화 데이터를 가져와 일반적으로 데이터 품질 관리 및 전처리, 데이터 정규화 및 차등 분석, 경로 및 기능 분석을 포함하는 다운스트림 분석을 처리합니다.
맞춤형 슬롯 커뮤니티 지원
- 대사체학, 미슬롯 커뮤니티군유전체, 메타오믹스 등과 같은 기타 오믹스 데이터 분석
- 데이터 마이닝, 모델링 및 시각화
- 슬롯 커뮤니티원과 학생을 위한 컴퓨팅 도구 호스팅 및 교육
- 데이터 품질 관리, 전력 연구, 가설 테스트, 회귀, 클러스터링, 네트워크 분석, 기능 주석, IPA®에 의한 경로 분석 등을 포함한 맞춤형 생물정보학 및 통계 슬롯 커뮤니티
프로젝트 상담 및 제안 지원
우리는 연구자들이 연구 및 연구 질문에 대한 효과적인 설계, 실행 및 분석을 할 수 있도록 안내하기 위해 연구자에게 생물통계, 생물정보학 및 염기서열 분석 슬롯 커뮤니티를 기꺼이 제공합니다. 또한 연구자가 경쟁력 있는 보조금을 받을 수 있도록 제안 전 단계에서, 그리고 원고 단계에서 방법 작성 및 데이터 시각화에 대한 지원을 제공합니다.
교육 및 훈련
우리는 조사관, 학생 및 협력 기관을 위한 워크숍, 세미나 및 개인 교육 세션을 수행합니다. 지난 워크숍에서는 Python 집중 과정, R 프로그래밍, BLAST 방법론, 시퀀스 어셈블리 및 기능 주석을 사용한 시퀀스 분석과 같은 주제를 다루었습니다.