슬롯 커뮤니티

7월 1일부터 유효함

슬롯 커뮤니티은 연중 정기적으로 평가되며 변경될 수 있습니다.

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저희 슬롯 커뮤니티에 대한 추가 세부정보

시간당 슬롯 커뮤니티 요금

실험실 작업이 필요한 모든 작업에는 이 시간당 요금이 부과됩니다.

예: 슬롯 커뮤니티에 없는 키트를 사용한 시퀀싱 라이브러리 구성

생어 슬롯 커뮤니티

2차 구조가 발생하기 쉬운 영역을 통과하는 데 도움이 되는 첨가제 추가 포함(e

재실행 정책:Sanger 반응을 다시 실행하기 위해 귀하로부터 샘플을 받겠습니다그리고내부 통제 성능이 좋지 않습니다.

각 스트립의 첫 번째 튜브 측면에 주문 번호를 쓰십시오.

목요일은 월요일에 처리되어 화요일에 데이터 전송됩니다.

단편 분석 샘플 준비

포름아미드 + LIZ 500 내부 크기 표준 마스터 믹스에 추가

다른 표준 사용에 대해 논의해야 할 경우 당사에 문의하십시오.

단편 분석 샘플 실행

우리는 적절하게 준비된 샘플(당사가 제공한 대로 또는 당사가 제공한 대로)을 모세관 젤에서 실행하고 FSA 데이터 파일을 제공합니다.

저희는 하루가 끝나거나 다음 날 이른 아침에 실행을 시작하고 데이터를 전달할 수 있습니다.

단편 분석 희석 최적화

사용할 최상의 희석을 결정하기 위해 조각 분석 샘플의 하위 집합에 대한 일련의 희석을 생성하는 것이 유용합니다.

당신이 준비한 그대로 샘플을 로드하겠습니다.

패널당 최대 8개의 샘플을 채취하여 최대 6개의 희석액을 생성합니다.

슬롯 커뮤니티 실행 시작

이것은 결정된 농도의 풀링된 슬롯 커뮤니티 라이브러리를 사용하여 모든 유형의 Illumina 슬롯 커뮤니티 실행을 시작하는 비용입니다.

실행을 시작하기 전에 샘플의 정량화를 권장합니다.당신이 스스로 도서관 집중도를 수량화하기로 결정하고 그것이 무엇인지 알려주십시오.

우리는 모든 샘플의 크기 분포를 요구합니다.도서관 크기 분포 데이터가 없고 원하는 경우

기기 또는 작업자 문제로 인해 실행 실패가 발생하는 경우

1% PhiX를 포함하는 것은 슬롯 커뮤니티 후 품질 검사를 위한 일상적인 것입니다.

풀링된 라이브러리 농도 확인

유효 농도는 Illumina 플로우 셀에서 클러스터를 형성할 수 있는 분자 수와 관련이 있습니다.

풀의 개별 샘플이 비슷한 크기 분포 프로필을 갖는 경우

선택한 참조 라이브러리는 동일한 유형의 라이브러리 준비 키트를 사용하여 준비되었으며 동일한 Illumina 기기에서 실행되었습니다.

우리 기기에서 한 번도 슬롯 커뮤니티된 적이 없는 특정 라이브러리 유형을 슬롯 커뮤니티하는 경우

도서관 풀링 슬롯 커뮤니티

이것은 도서관 준비 슬롯 커뮤니티 가격에 포함되어 있습니다.우리는 동일한 표준 곡선을 사용하여 라이브러리 농도를 정량화하기 위해 정량화 키트를 사용할 것입니다.

Illumina 도서관 건설

우리는 귀하가 제공한 샘플로부터 슬롯 커뮤니티 라이브러리를 생성하기 위해 상용 키트를 사용할 것입니다.

현재 다음 키트를 보유하고 있습니다:

1. Illumina DNA Prep(이전의 Nextera Flex): 태깅을 사용하여 대부분의 DNA 유형에서 라이브러리를 구성
   • 1-500ng 입력(대형 게놈의 경우 최소 100ng)
2. Illumnia 가닥 mRNA 준비: 폴리A가 풍부한 mRNA 라이브러리 구축
   • 1 ug 총 RNA 입력(500ng 선호)
   • 다른 인서트 크기가 필요한 경우 우리와 논의하십시오.

모든 샘플 준비 슬롯 커뮤니티 가격에는 다음이 포함됩니다:

• 라이브러리 정량화(풀링에 도움이 필요함)
• 샘플 풀링

Bioanalyzer를 사용하여 풀링을 실행하기 전에 샘플의 크기 분포를 알아야 합니다.

슬롯 커뮤니티 라이브러리 준비 프로젝트를 시작하기 전

1. dsDNA 또는 RNA의 양은 특정 방법을 사용하여 결정되어야 합니다(e
2. mRNA 라이브러리 생성의 경우: 각 샘플의 총 RNA 품질 평가
3. 프로젝트 세부사항에 따라 기타 정보가 요청될 수 있습니다.단일 세포 슬롯 커뮤니티을 위한 샘플당 세포).

PCR 정리

일반적으로 Sanger 슬롯 커뮤니티 전에 PCR 산물을 정리하기 위해 수행PCR 반응의 이전 dsDNA 정량은 포함되지 않습니다.샘플은 dsDNA 농도를 정량화해야 하며 대신 많은 수의 샘플을 하위 샘플링하여 모든 샘플에 적용할 평균 농도를 얻을 수 있습니다.

DNA 정량

큐비트 dsDNA: 1-48개 샘플
피코그린 플레이트 분석: 샘플 48개 이상

플레이트 기반 분석 표준

우리는 DNA 정량화를 위해 dsDNA 결합에 특정한 염료를 사용합니다.

플레이트 기반 분석 표준 곡선을 생성하기 위해 7가지 표준을 3중으로 사용합니다.

샘플을 준비하고(필요한 경우 희석) 번호가 매겨진 스트립 캡으로 구성

플레이트 기반 분석은 판독값이 표준의 선형 범위를 벗어났기 때문에 불확실한 값을 보고합니다.

RNA 정량

큐비트 RNA: 1-48개 샘플
플레이트 분석: 샘플 48개 이상

플레이트 기반 분석 표준

우리는 RNA 정량화를 위해 RNA 결합에 특이적인 염료를 사용합니다

샘플 제출에 대한 관련 정보는 DNA 정량 섹션을 참조하세요.

Agilent Bioanalyzer 2100 실행

필요에 따라 TapeStation 정보를 참조하십시오.

TapeStation 4150 실행

다음 스크린테이프를 사용할 수 있습니다:

• D1000 DNA 스크린테이프
• 고감도 D1000 DNA 스크린 테이프
• RNA 스크린테이프

우리가 사용할 수 있거나 얻을 수 있는 다른 ScreenTape이 몇 가지 있습니다.

• D5000 DNA 스크린 테이프
• D5000 고감도 DNA 스크린 테이프
• 고감도 RNA 스크린테이프
• 무세포 DNA 스크린테이프
• 게놈 스크린 테이프

스트립 튜브에 정렬된 최소 3ul의 샘플을 제공하세요.

RNA 샘플을 73°로 가열하는 것은 표준 프로세스입니다.

일반적으로 DNA 종의 크기가 더 넓을수록(e

무료 TapeStation 분석 소프트웨어를 다운로드하여 XAD 파일을 볼 수 있습니다.https://bit.ly/3nzGDgG이 콘텐츠에 액세스하는 데 문제가 있는 경우네바다 유전체학 센터에 문의.